l 1° Gennaio del 2001 la popolazione del pianeta Terra è decimata da una catastrofe climatica senza precedenti, una seconda era glaciale che congela il pianeta per novecento anni. I superstiti, protetti dalla luce del Cristallo d'Argento, vengono risvegliati nel 30° secolo da Usagi Tsukino, che proclamano regina del nuovo mondo: Crystal Tokyo. Sotto la guida di Neo-Queen Serenity e del suo consorte, Re Endymion, la Terra conosce periodi di pace senza precedenti. Tuttavia, qualcosa non torna. I nemesiani non si ribellano, e perciò non vengono banditi dal pianeta. L'oscurità che avrebbe dovuto giungere subito dopo la glaciazione non si manifesta. Niente del futuro così come lo avevano conosciuto si avvera. Chibiusa stessa non nascerà mai: il 1° Luglio del 2991 la regina dà alla luce una bambina diversa. Ha i capelli neri, anziché rosa, ed occhi grandi e blu, non rossi. Eppure il tempo non è stato alterato, persino Sailor Pluto lo conferma. È tutto come dovrebbe essere. Allora perché quell'insperata felicità sembra sbagliata, quasi immeritata? I sovrani e le guerriere passano diciotto anni a cercare una risposta che non troveranno mai. Alcuni si rassegnano al nuovo futuro, mentre altri, come il re e la regina, non smettono mai di provare a sistemare le cose. Nel frattempo, Crystal Tokyo è presa di mira dagli attacchi terroristici di un misterioso gruppo di ribelli, che considerano blasfemi i cittadini e la popolazione, a causa della longevità data dal Cristallo d'Argento. Lo scopo della ribellione non è chiaro, e i suoi sostenitori sono come dei fantasmi. Lasciano dietro sé soltanto un simbolo, quello della luna nera. Nonostante il Black Moon Clan, in questa linea temporale, non esista. Gli attentati culminano il 1° luglio del 3000 col rapimento della regina, che lascia Crystal Tokyo nel caos, ed un re sgomento a governare da solo. Che i primi anni di pace fossero solo un preludio ad una tragedia maggiore di quella che si aspettavano?